Buchhaltungssoftware für Onlineshops: die besten Programme 2026

Onlineshops haben andere Anforderungen als Freelancer: hunderte Bestellungen, mehrere Zahlungsanbieter (PayPal, Stripe, Klarna), Differenzbesteuerung, EU-Umsatzsteuer und Marketplace-Regeln. Eine Software mit direkter Shop- und Zahlungsanbindung spart hier Stunden pro Woche. Die gelisteten Anbieter sind nach Shop-Integrationen und Nutzerbewertungen gerankt – der Blogartikel „Buchhaltung für E-Commerce-Shops“ zeigt die Details.

Die besten Anbieter für onlineshops: die besten programme 2026

Lexware Office Redaktionsempfehlung

★★★★★ 4,3

Marktführer aus Deutschland mit großem Funktionsumfang: Rechnungen, EÜR, doppelte Buchführung und viele Integrationen.

💶 13,90–69,90 €/Monat 🌍 DE

Qonto

★★★★★ 4,3

Business-Girokonto mit integrierter Buchhaltung: Rechnungen, Belegerfassung, EÜR und Export zum Steuerberater.

💶 9–89 €/Monat 🌍 DE, AT, CH

Zoho Books

★★★★★ 4,1

Internationale ERP-ähnliche Buchhaltung mit riesigem Funktionsumfang und sehr fairen Preisen (free bis 50.000 USD Umsatz/Jahr).

💶 0–66 €/Monat 🌍 DE, AT, CH

easybill

★★★★★ 4,0

Starke Rechnungs- und Versandabwicklung, beliebt bei Onlinehändlern (Amazon FBA, eBay) inkl. Sammelrechnungen.

💶 20–79 €/Monat 🌍 DE, AT

Alle Preise und Bewertungen ohne Gewähr. Transparent: Bei manchen Links erhalten wir eine Provision (*).

Top-5 im Überblick

AnbieterNotePreis/MonatEÜRBilanzE-RechnungDetails
Lexware Office 4,3 ab 13,90 €/Monat ✔ ✔ ✖ Zur Seite*
Qonto 4,3 ab 9 €/Monat ✔ ✔ ✖ Zur Seite*
Zoho Books 4,1 auf Anfrage ✔ ✔ ✖ Zur Seite*
easybill 4,0 ab 20 €/Monat ✔ ✖ ✖ Zur Seite*

Worauf es ankommt

✔ Shop-Anbindung: Shopify, WooCommerce, Amazon, eBay, Gambio – je nach Plattform konkret prüfen.

✔ Zahlungsanbieter: PayPal, Stripe, Klarna müssen automatisch importiert und zugeordnet werden können.

✔ EU-USt und OSS: Grenzüberschreitende Verkäufe brauchen One-Stop-Shop-Unterstützung.

✔ Massendaten: Belegimport in Stückzahlen statt Einzelbooking.

✔ Inventur/Artikelbestände: Optional, aber hilfreich für Lagerhaltende Shops.

Häufige Fragen

Welche Software bindet Shopify an?

easybill, Lexware Office und sevdesk bieten Shopify-Connectoren. Im Detailvergleich siehst du alle Integrationen je Anbieter.

Wie werden PayPal- und Stripe-Zahlungen gebucht?

Gute Programme importieren Zahlungsläufe als Sammelbeleg und trennen Gebühren automatisch. Manuelle Zuordnung bleibt für Ausnahmen.

Was bedeutet OSS für die Buchhaltung?

One-Stop-Shop-Fälligkeiten müssen aus den Verkaufsdaten erzeugt werden. Nur wenige Tools automatisieren das komplett – im Vergleich nach „OSS/EU-USt“ filtern.

Kann ich die Buchhaltung outsourcen?

Ja, Anbieter wie „run my accounts“ machen die komplette Buchhaltung für Shops. Für AT/CH gibt es regionale Varianten.

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